真核转录组测序
技术优势
技术路线
分析内容
1. 原始数据产出统计; | 2. 与参考基因组比对及统计; |
3. 基因和转录本表达丰度分析; | 4. 转录组水平SNP和InDel分析; |
5. GO功能分析; | 6. KEGG代谢通路分析; |
7.基因差异表达谱分析(聚类图,散点图,火山图); | 8. 差异表达基因的GO功能富集性分析,KEGG代谢通路富集性分析; |
9.新转录本预测; | 10.可变剪切分析; |
11.DEU(Differential Exon Usage)分析(限生物学重复样品)。 |
1.原始数据产出统计与基本质控处理; |
2.转录本拼接(根据测序数据获得转录本序列); |
3.Unigene和transcript的长度分布统计及GC含量统计; |
4.根据拼接结果序列进行预测编码蛋白框(CDS); |
5.Unigene功能注释(NR、Swissport、KOG、KEGG、Pfam); |
6.Unigene的GO(Gene Ontology)注释结果; |
7.Unigene的KEGG代谢通路注释; |
8.Unigene的KOG注释结果; |
9.转录组水平SNV/SNP分析; |
10.Unigene的SSR分析(SSR数据信息、SSR分布统计); |
11.根据RPKM计算标准对基因表达丰度进行分析(表达量数据信息、表达情况统计); |
12.样本间的基因表达差异分析; |
13.差异表达基因的GO功能富集性分析,KEGG代谢途径富集性分析。 |
样本类型
结果展示
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